Quelques commandes utiles sur CAPARMOR (ou un autre supercalculateur)

Sur CAPARMOR quand vous êtes logués sous votre nom, tous les fichiers de simulation sont dans le répertoire isis-tmp

Voir l'état de la queue de simulations caparmor

qstat

Voir l'etat d'avancement d'un job

qstat -f <iddujob>

Exemple:

qstat -f 1234567[].service0

Lire les logs

En cas de plantage pour consulter les logs, lire le fichier simulation-sim...-output.txt:

cat simulation-sim...-output.txt

Relancer les simulations d'un plan

Si besoin de relancer les simus d'un plan (simu 5 à 10 par ex):

qsub -J 5-10 simulation-sim_...-script.seq

Récupérer des résultats récalcitrants

Si la simulation s'est terminée mais les résultats n'ont pas été rapatriés, il faut récupérer le fichier simulation-sim...-result.zip en le copiant sur le serveur d'échange par exemple

cp *-result.zip /home/navidad/partages/echange/sigrid

Commandes Unix

Une page web bien utile pour les commandes Unix en general : http://www.infres.enst.fr/%7Edanzart/unix_abrege.html#exemples